Joël Ceccaldi est marié et père de cinq enfants. Il est membre d’une communauté protestante évangélique de la banlieue bordelaise. Il a exercé deux années comme médecin au Nord du Burundi dans un hôpital de brousse, entre 1976 et 1978. L’unité hospitalière dont il est actuellement responsable à Libourne, accueille des personnes atteintes de maladies du sang et d’infection VIH (sida). Il s’intéresse aussi aux questions de bioéthique, en particulier à celles qui touchent aux limites de la vie humaine et de la personne.